از اوائل پيروزي انقلاب اسلامي احساس مي شد كه فضاي فرهنگي دانشگاهها به اندازه كافي با جريان اسلامي و انقلابي مردم هماهنگ نيست و روي هم رفته جو دانشگاهها به علت وجود تعدادي از استادان غرب زده و نيز دانشجويان عضو گروههاي ضد انقلاب ، مناسب نبود . در تاريخ 2/1/1359 امام خميني رحمه الله عليه در پيامي چگونگي دانشگاه مطلوب را ترسيم نمود . بعد از اين پيام خشونتهاي گروهها در دانشگاهها بعد تازه اي يافت كه ضرورت تحول در آن ديده مي شد . در 28 فروردين 59 عده اي از دانشجويان گروهكي ، دانشگاه تبريز را به كنترل در آوردند . فرداي آنروز ضد انقلاب دانشگاه تربيت معلم تهران را تصرف كرد كه پس از مهلت سه روزه شوراي انقلاب ، دانشگاه از تصرف درآمد . پس از آن ، دانشگاهها تعطيل شد و امام خميني رحمه الله عليه در پيامي به « ستاد انقلاب فرهنگي » ضرورت تحول در اين نظام مهم آموزشي را بيان كردند . تعطيلي دانشگاهها تا آذر سال 61 به طول كشيد.